Jakość żywności jest pojęciem szerokim. Składa się na nią bezpieczeństwo żywności, wartość odżywcza (zawartość związków niezbędnych do prawidłowego funkcjonowania organizmu człowieka takich jak witaminy, białka, cukry oraz niski poziom substancji szkodliwych), walory smakowe, zapachowe oraz wygląd, opakowanie i oznakowanie.

Na rynku znajduje się wielka różnorodność produktów, z których zdecydowana większość wytwarzana jest w sposób konwencjonalny. Biorąc pod uwagę tę olbrzymią różnorodność, nasuwa się pytanie skąd coraz większe zainteresowanie żywnością ekologiczną.

Wiele badań wskazuje na to, że szereg zanieczyszczeń żywności ma swoje źródło w chemizacji rolnictwa.  Natomiast żywność pochodząca z rolnictwa ekologicznego jest postrzegana jako zawierająca mniej skażeń, a zatem bardziej korzystna dla organizmu człowieka, niż ta produkowana metodami konwencjonalnymi. Uznaje się, że żywność pochodząca z certyfikowanych gospodarstw ekologicznych i przetwórni, gdzie wykorzystywane są ekologiczne surowce i naturalne dodatki, ma wysoką jakość. Żywność ta jest niemal całkowicie wolna od pozostałości środków chemicznych  albo ich poziom jest dużo niższy niż w przypadku produktów wytwarzanych metodami konwencjonalnymi. Dzieje się tak ponieważ produkcja ekologiczna opiera się m.in. na:

• eliminowaniu syntetycznych środków ochrony roślin i nawozów sztucznych,
• eliminowaniu użycia w żywieniu zwierząt antybiotyków, kokcydiostatyków, środków farmaceutycznych, stymulatorów wzrostu lub innych środków służących do stymulowania wzrostu lub produkcji,
• zakazie stosowania organizmów przekształconych genetycznie (GMO),
• ograniczeniu stosowania syntetycznych środków konserwujących i ulepszaczy, 
• zakazie stosowania pasz przemysłowych.

Zasadą jest także, że w przetwórstwie można stosować tylko certyfikowane surowce pochodzące z gospodarstw ekologicznych.
Konsumenci oceniają, że warzywa i owoce pochodzące z gospodarstw ekologicznych charakteryzują się wyraźniejszym smakiem (m.in. dzięki większej zawartości cukru) i zapachem, przez co oceniane są znacznie wyżej niż produkty konwencjonalne i często określane są jako „smaki dzieciństwa”.

Dla konsumenta podstawowym gwarantem jakości żywności ekologicznej jest funkcjonujący w rolnictwie ekologicznym system kontroli i certyfikacji.